Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn11Q6J756 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn11Q6J756 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms