Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc3c1Q6DFV6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fndc3c1Q6DFV6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms