Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CltcQ68FD5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CltcQ68FD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CltcQ68FD5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CltcQ68FD5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1727.6 ms