Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a2Q62203 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3a2Q62203 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms