Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcd1Q61466 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcd1Q61466 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms