Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxd1Q61345 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Foxd1Q61345 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms