Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc125Q5U465 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms