Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms