Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znrf3Q5SSZ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znrf3Q5SSZ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znrf3Q5SSZ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms