Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rbm27Q5SFM8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm27Q5SFM8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm27Q5SFM8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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