Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc44a5Q5RJI2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc44a5Q5RJI2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms