Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf38aQ4FK66 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms