Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc9a2Q3ZAS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a2Q3ZAS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms