Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930567H17RikQ3V0K5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930567H17RikQ3V0K5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
4930567H17RikQ3V0K5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms