Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm5aQ3UXZ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm5aQ3UXZ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm5aQ3UXZ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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