Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtl4Q3URY0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtl4Q3URY0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms