Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkain3Q3URJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkain3Q3URJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms