Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acsf3Q3URE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acsf3Q3URE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms