Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srebf2Q3U1N2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srebf2Q3U1N2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Srebf2Q3U1N2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms