Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem104Q3TB48 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem104Q3TB48 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms