Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VrtnQ3SYK4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VrtnQ3SYK4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms