Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Specc1lQ2KN98 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Specc1lQ2KN98 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Specc1lQ2KN98 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms