Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrriq3Q14DL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrriq3Q14DL3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms