Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd3Q14AI6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rpusd3Q14AI6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rpusd3Q14AI6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd3Q14AI6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms