Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bpifa6Q0VGU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bpifa6Q0VGU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.7 ms