Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms