Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc138Q0VF22 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc138Q0VF22 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc138Q0VF22 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms