Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rundc1Q0VDN7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms