Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pate4Q09098 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms