Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MitfQ08874 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms