Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdr16c6Q05A13 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr16c6Q05A13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms