Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top1Q04750 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top1Q04750 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms