Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pfdn6Q03958 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfdn6Q03958 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pfdn6Q03958 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms