Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddr1Q03146 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddr1Q03146 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddr1Q03146 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms