Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa1Q00623 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoa1Q00623 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms