Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1bP97358 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1bP97358 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms