Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sumo1P63166 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sumo1P63166 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms