Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps11P62281 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps11P62281 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps11P62281 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps11P62281 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps11P62281 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms