Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CgnP59242 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CgnP59242 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CgnP59242 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CgnP59242 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CgnP59242 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CgnP59242 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CgnP59242 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CgnP59242 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CgnP59242 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CgnP59242 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CgnP59242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CgnP59242 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CgnP59242 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CgnP59242 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CgnP59242 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CgnP59242 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CgnP59242 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CgnP59242 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CgnP59242 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CgnP59242 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CgnP59242 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CgnP59242 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CgnP59242 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms