Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphp4P59240 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp4P59240 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nphp4P59240 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms