Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rhbdl3P58873 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rhbdl3P58873 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhbdl3P58873 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rhbdl3P58873 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.6 ms