Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bace1P56818 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bace1P56818 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bace1P56818 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms