Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl9P51670 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl9P51670 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms