Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox2P48432 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms