Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CratP47934 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CratP47934 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CratP47934 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CratP47934 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CratP47934 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CratP47934 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CratP47934 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CratP47934 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CratP47934 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CratP47934 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CratP47934 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CratP47934 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CratP47934 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CratP47934 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CratP47934 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CratP47934 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CratP47934 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CratP47934 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CratP47934 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CratP47934 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CratP47934 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CratP47934 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CratP47934 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CratP47934 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CratP47934 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CratP47934 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CratP47934 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CratP47934 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CratP47934 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CratP47934 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CratP47934 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CratP47934 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms