Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc2P46471 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc2P46471 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc2P46471 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms