Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf1P46099 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf1P46099 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Klf1P46099 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf1P46099 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf1P46099 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf1P46099 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms