Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hmx3P42581 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hmx3P42581 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hmx3P42581 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms