Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TfamP40630 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TfamP40630 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TfamP40630 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TfamP40630 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TfamP40630 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TfamP40630 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TfamP40630 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TfamP40630 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TfamP40630 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TfamP40630 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TfamP40630 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TfamP40630 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TfamP40630 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TfamP40630 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TfamP40630 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TfamP40630 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TfamP40630 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TfamP40630 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TfamP40630 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TfamP40630 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TfamP40630 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TfamP40630 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms