Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Folr1P35846 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Folr1P35846 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Folr1P35846 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Folr1P35846 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Folr1P35846 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Folr1P35846 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Folr1P35846 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Folr1P35846 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Folr1P35846 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Folr1P35846 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Folr1P35846 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Folr1P35846 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Folr1P35846 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Folr1P35846 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Folr1P35846 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Folr1P35846 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Folr1P35846 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Folr1P35846 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms